Sega llegó a un acuerdo con Warner Bros Interactive Entertainment para realizar conjuntamente un juego online basado en las películas de Matrix. Sega se encargaría de la distribución del juego, mientras que Warner Bros supervisaría su desarrollo y las operaciones y ambas empresas trabajarían conjuntamente en el marketing. Se espera que el juego sea lanzado este noviembre.

Un videojuego de consola Enter the Matrix de Atari tuvo malas críticas de la prensa especializada, pero aún sigue vendiendo millones de unidades. Matrix Online iba a ser publicado por Ubi Soft Entertainment, pero la empresa se retiró del proyecto a principios de este año.